结构蛋白质组学为揭示蛋白质热稳定性的普遍原理提供了一种有前景的方法。qProtein利用先进的深度学习模型和计算工具批量收集和分析蛋白质结构，从广泛的蛋白质结构中提取热稳定性的共同物理特征。论文介绍了一种基于结构蛋白质组学提取蛋白质分子内相互作用特征的工作流算法。该方法以大量的蛋白质一级序列为输入，将其批量转化为蛋白质结构数据。之后，该算法定量计算了蛋白质结构中4种相互作用力的含量（Hydrophobic interaction 疏水相互作用，Hydrogen bond 氢键， Salt-bridge 盐桥，Disulfide bond 二硫键）。为了验证该方法的可靠性，我们的论文中通过对比分析嗜热酶和非嗜热酶两种蛋白质结构中四种不同相互作用的含量，发现了相较于非嗜热酶而言，嗜热酶结构中存在更多的疏水相互作用。
